在大量的工程實踐中，由于合同雙方現實環(huán)境和相關條件的變化，往往會出現合同變更，而這些變更必須根據合同的相關條款進行適當地處理。如果某一方不理解合同條款，或不嚴格執(zhí)行合同條款，那么該方會付出額外的代價以完成額外的工作任務。
    合同變更的處理由合同變更控制系統(tǒng)來完成。合同變更控制系統(tǒng)包括文書記錄工作、跟蹤系統(tǒng)、爭議解決程序以及各種變更所需的審批層次。合同變更控制系統(tǒng)是項目整體變更控制系統(tǒng)的一部分。任何合同的變更都是以一定的法律事實為依據來改變合同內容的法律行為。
    有多種因素會導致合同變更，例如范圍變更、成本變更、進度變更、質量要求的變更甚至人員變更都可能會引起合同的變更，乃至重新修訂。
    對于任何變更的評估都應該有變更影響分析。例如，變更將如何影響所采購產品及服務的范圍、進度、質量等，這些影響會不會傳遞到項目的其他部分？
    變更申請、變更評估和變更執(zhí)行等必須以書面形式呈現。
    合同變更在某種意義上，還應該包括合同的轉讓和鋸除，這要視合同實際執(zhí)行情況而定。這兩種變更需要合同雙方當事人協商一致，才可以協議執(zhí)行。如有重大爭議，可以通過法律或仲裁手段解決。
    按照合同簽約各方的約定，合同變更控制系統(tǒng)的一般處理程序如下：
    (1)變更的提出。合同簽約各方都可以向監(jiān)理單位（或變更控制委員會）提出書面的合同變更請求。
    (2)變更請求的審查。合同簽約各方提出的合同變更要求和建議，必須首先交由監(jiān)理單位（或變更控制委員會）審查后，提出合間變更請求的審查意見，并報業(yè)主。
    (3)變更的批準。監(jiān)理單位（或變更控制委員會）批準或拒絕變更。
    (4)變更的實施。在組織業(yè)主與承包人就合同變更及其他有關問題協商達成“致意見后，由監(jiān)理單位（或變更控制委員會）正式下達合同變更指令，承包人組織實施。
    “公平合理”是合同變更的處理原則，變更合同價款按下列方法進行。
    (1)首先確定合同變更量清單，然后確定變更份款。
    (2)合同中已有適用于項目變更的價格，按合同已有的價格變更合同價款。
    (3)合同中只有類似于項目變更的價格，可以參照類似價格變更合同價款。
    (4)合同中沒有適用或類似項目變更的價格，由承包人提出適當的變更價格，經監(jiān)理工程師和業(yè)主確認后執(zhí)行。